في قسم أمراض الجهاز الهضمي، يتم تقييم وتقدير وإدارة ومعالجة مختلف أمراض الجهاز الهضمي وفحصها وتشخيصها وعلاجها في جميع العنابر وكذلك توفير الرعاية الصحية للمرضى الخارجيين في قسم العيادات الخارجية ووحدة التنظير  الداخلي.

ومن أمثلة الأمراض التي تصيب الجهاز الهضمي هي اضطرابات الجهاز الهضمي والأمعاء مثل أمراض التهاب الأمعاء (IBD) ونزيف الجهاز الهضمي والقرحة المعدية /قرحة الاثني عشر والارتجاع المعدي المريئي واضطرابات الأمعاء الوظيفية مثل مرض القولون العصبي وكذلك أمراض الكبد الحادة والمزمنة بما فيها اضطرابات المرارة / المثانة.

في وحدة قسم المنظار يتم إجراء الفحوصات مثل التنظير التشخيصي والعلاجي وتنظير القولون وتصوير الأقنية الصفراوية والبنكرياس بالتنظير الباطني بالطريق الراجع (بمنظار تشولانجيو-البنكرياسوغرافي العلاجي الداخلي) لكل من الحالات المختارة أو حالات الطوارئ. وتخضع وحدة التنظير للتطوير التدريجي الواسع والتي ستتحول تدريجيا خلال عام 2018 إلى وحدة متخصصة متعددة الوظائف. وفي العام التالي، سيتم تطوير وحدة تنظير جديدة تماما ذات قدرة عالية لأداء مختلف إجراءات التنظير بدرجة عالية،